miniSTR分型中,上海亲子鉴定中心等位基因扩增片段大小的缩减程度与传统STR分型引物距离STR重复区的远近有关。传统STR荧光复合扩增体系中,为了得到理想的扩增片段长度,满足特定的复合检测体系的需要,大片段STR基因座的PCR引物均远离STR重复区域,这给重新设计引物、减小扩增产物大小提供了较大的空间。例如,PowerPlex 16荧光复合扩增体系中.Penta D基因座的两条引物分别结合于(AAAGA)核心序列的上游71bp及下游247bp处,由此得到的扩增产物长度范围为376—449bp,等位基因的核心序列重复次数为2.2—l7次。当引物被移至重复序列上游llbp和下游191Jp处时,扩增产物缩短282bp,在等位基冈核心序列重复次数不变的情况下,扩增产物长度范围缩减为9止~67bp。上海亲子鉴定中心列出了部分miniSTR基因座与传统STR分型相比等位基因长度的缩减情况。
2022-01-22 17:10:21
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